2021年5月末,美国总统拜登下令:对新冠流感病毒更早进行为其90天的调查。8月末下旬是深入研究报告最后时限。
尽管很多人在焦虑地等待问卷调查,不过CNN深入研究报告了消息灵通专业人士的断言:
"nothing too earth shattering,"
(没有什么惊心动魄的真的)
而另外一边,科学知识家从学术研究的本质,亦从并未舍弃辨清爽冠流感病毒的更早。
2021年8月末19日,Cell杂志上架了Andrew Rambaut,Kristian Andersen和Edward Holmes等人关于SARS-CoV-2更早的研究成果,引致了大量登出和热议。
从流感开始,关于流感病毒更早的分子生物学研究和研究成果很多都来自于这三个研究组成员,因此他们也是我引用和卫报多达的流感病毒更早散文家。
Holmes和武汉大学合作,在流感开始后第一小时在virological.org上传了第一个SARS-CoV-2脱氧核糖核酸,成为了现在所有诊断试剂捆疫苗施打联合开发的独有脱氧核糖核酸;其去年刊载的Cell研究成果是流感病毒更早的一篇等奖项。
Andersen去年在virological.org和Nature Med的讨学术著作章指明了流感病毒更早研究的方向,成为了被引用多达的相关学术著作。
因此,这篇简介研究成果可以时说来自于这个领域最正当性的专家根据简介信息的重要阐述。
之前我在微博上深入研究流感病毒脱氧核糖核酸和解读很多冠状流感病毒跨种传播出于好奇心,而现在这些章节转成了我的工作核心章节。我现在联合开发COVID-19疫苗施打并不需要深入研究大量猫冠状流感病毒的脱氧核糖核酸和Western Blot结果,并紧密结合载体和假流感病毒,解读中和结果;因为这一从好奇心到工作章节的转变,让我对猫冠状流感病毒跨种传播有了很多新的专业认识。而这篇简介研究成果结合了WHO深入研究报告,从简介的科学知识数据本质指出了现在哺乳类跨种传播是SARS-CoV-2的最可能来源。
虽然2013年在通关乡注意到的RaTG13是现在已知与SARS-CoV-2基因脱氧核糖核酸最近的冠状流感病毒,但现在科学知识界的共识是RaTG13不是SARS-CoV-2的血缘,而更可能是两个完全相同进化小枝上的独立流感病毒;从ORF1ab等脱氧核糖核酸判断,另外三种在云南注意到的猫冠状RmYN02,RpYN06和PrC31的潜在基因型重组成员流感病毒(尚并未被注意到)可能与SARS-CoV-2的血缘更为近,这些研究来自于中国史家和Holmes。
我特别时说,冠状流感病毒跨种传播更为时有,但是呈现出大风行却门槛很高。然而遗憾的是,SARS-CoV-2的猫寄主或下部哺乳类寄主当今世界仍并未被注意到,最初的跨物种传播事件真相也并未被注意到,这可能是因为尚并未对正确的哺乳类物种或种群进行采样,或者SARS-CoV-2的先祖流感病毒处于较差风行状态。
事实上,很多全人类病原体(除此以外埃博拉流感病毒、丙型肝炎流感病毒、脊髓灰质炎流感病毒以及冠状流感病毒HCoV-HKU1和HCoV-NL63)的哺乳类更早尚并未确定, 而史家通过十几年的密集研究才注意到了与SARS-CoV具备将近95%的相似性并且可用人ACE2作为受体的猫冠状流感病毒,从而锁定了其可能的猫更早。
关于Lab Leak Theory,历史上全世界lab leak(的实验室告密)病原体的事件真相并不一定罕见,但从并未有lab leak引致大风行的可能。这是因为lab leak相对于自然更早更容易注意到和控制。这篇研究成果社论从科学知识事实上,设法反驳了Shi组成员可能显现出来的实验室告密的可能。
社论全盘细致地检索了比较好的科学知识事实:WIV刊载的所有bat-CoV研究学术著作,指出WIV和Shi组成员只成功分立和培养出3种猫冠状流感病毒,WIV1-CoV,WIV16-CoV和Rs4874(Ge et al., 2013;Hu et al., 2017;Yang et al., 2015),这三种流感病毒与SARS-CoV更为近,与SARS-CoV-2距离较多于。但是RaTG13从并未被成功分立和培养。WIV也从并未分立或者紧密结合具备明晰的Furin脱氧核糖核酸的猫冠状流感病毒。
理论上上,Furin脱氧核糖核酸也见诸其他冠状流感病毒如MERS-CoV,HCoV-OC43和HCoV-HKU1;而SARS-CoV-2可用的RRAR脱氧核糖核酸是非常较差效的蛋白酶切割方式。现在仅有的在SARS-CoV中加入Furin脱氧核糖核酸并不一定来自WIV(Belouzard et al., 2009;Follis et al., 2006)。
另外,被坚称人工添加的CGG肽链也见诸SARS-CoV。
兼具争议的Gain-of-Function在流感前并不一定是一个具备争议的流感病毒学研究,国际流感病毒科学界相关研究很多。WIV可用过SARS-CoV和WIV1-CoV骨架作为载体,但与SARS-CoV-2距离甚多于。
WIV更并未开展过启动时遗传技术紧密结合活冠状流感病毒。
因此,没有任何科学知识事实指向的实验室告密。
同时,SARS-CoV-2不是猫冠状流感病毒通过体外传代原辨和哺乳类施打为了让原辨建立联系的。SARS-CoV-2独有毒株无法病菌果蝇,可以病菌大量哺乳类的N501Y突变株是在天庭国际上风行中呈现出的。
这一点理论上被流感病毒风行更进一步反复验证。
SARS-CoV-2增强流感病毒灵活性从而增大与ACE2结合灵活性,增大传播灵活性和免疫逃逸的关键突变(D614G,N501Y,K417N/T,L452R和E484K/Q)全部是在天庭大风行后实现的,而不是“的实验室内刻意筛选的”。这一流感病毒在天庭风行从而增大灵活性的更进一步,提示流感病毒后期风行时的脱氧核糖核酸和表型并不一定是流感病毒最佳的灵活性状态。
我虽然常时说冠状流感病毒跨种风行时有,但现在看来,其引起天庭大风行的频率却是也在加快。
这篇具备正当性性质研究成果的意图,或许也是我反复强调的,就是找到流感病毒自然更早的哺乳类寄主和跨种传播途径对预防今后的冠状流感病毒跨种风行至关重要。
独有出处:
Edward C. Holmes, et al. The Origins of SARS-CoV-2: A Critical Review.Cell, 2021. DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.08.017.
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